Puoi settare la trasparenza attraverso diversi effetti 2D-3D
Basta che selezioni l'effetto (io uso sempre il 3D Editor CPU), togli la preimpostazione in modo da riportare il clip alle dimensioni originali e poi agisci sulla "trasparenza".
Se hai già la clip nella traccia superiore puoi cliccare in basso sul bottone "SOLO" e vedi in tempo reale le due tracce man mano che aumenti il livello di trasparenza.
p.s Come mai è stato disabilitato l'upload delle immagini in questa sezione? Sono sempre utili per spiegare meglio in modo visuale!