Hast Du die Kapitel automatisch oder manuell erstellt? Wenn Du auf der Timeline auf das entsprechende Untermenü doppelklickst und dann über die kleinen < und > -Tasten die Kapitel abgehst kannst Du einfach überprüfen, ob die Kapitel auch an der von Dir gewünschten Stelle liegen. So wie das auf Timeline dargestellt ist kommt das dann auch auf die DVD, ist das bei Dir anders?
Oder möchtest Du per Untermenü auch auf die Kapitel springen können, die Du im Hauptmenü angelegt hast? Dazu müßtest Du im Untermenü noch eine Sprungmarke einen Frame neben der vorhandenen vom Hauptmenü setzen (2 Marken an derselben Stelle gehen nicht).
Falls es das alles nicht ist, müßtest Du Dein Problem nochmal genauer beschreiben, bzw. wie Deine Menüstruktur letztlich aussehen soll, das ist mir noch nicht ganz klar.