Bei solch einem hartnäckigem Fehler würde ich das Projekt in 2 Teile teilen: einen Cut nach 30 min machen, dann den hinteren Teil des Projektes (ab diesem Cut) löschen (NICHT anschliessend SPEICHERN) und ausgeben lassen.
Danach auf rückgängig gehen (oder das Projekt neu laden) , den vorderen Teil des Projektes (also alles bis zu Minute 30) löschen und den hinteren Teil des Projektes ausgeben.
Falls hier wieder der Fehler auftreten sollte, erneut den hinteren Teil abtrennen (dann eben ab Minute 55) und dann dieses Mittelstück ausgeben lassen.
In diesem Fall dann eben mal im nachfolgenden 3. Schritt genau schauen, was denn da so vorliegt bei Minute 56:05 und ggf. ändern.
Die 2-3 berechnetenen Teile dann in einem neuen Projekt zusammenfügen und als 1 Datei ausgeben lassen.