Ich vermute mal, dass dies an den unterschiedlichen Komprimierungsverfahren der Programme, bzw. an den ausgeführten Korrekturen liegt.
Die Wiedergabezeit sagt ja noch nichts über die Dateigröße aus. Wenn Du jetzt Deine Tonspur als mp3 exportierst und bearbeitest, hat sie warscheinlich eine andere Dateigröße als vorher.
Studio hat aber an der Stelle wo Du die Datei entnommen hast nur einen bestimmten Speicherplatz (Speichervolumen) reserviert.
Ist die bearbeitete Datei jetzt größer, paßt sie halt nicht mehr in den vorgehaltenen Speicherraum und muß daher verkürzt werden.
Da bei WAV diese Komprimierungsunterschiede nicht auftreten, gibt es damit auch weniger oder keine Probleme!